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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

打好“组合拳”，中医药助力新冠患者救治******

　　近期，长沙市中医医院（长沙市第八医院）无数中医专家奔忙在门诊病房，通过把脉问诊、辨证施治，充分运用传统中医特色治疗方法帮助新冠患者减轻症状、缩短病程，守护患者健康。

　　“喝了卿老开的方子后，体温马上降了，七副药喝完，症状明显减轻。”在长沙市中医医院名中医馆诊室，湖南省名中医卿照前正在为患者李先生把脉问诊。疫情期间，中医药让越来越多的患者受益，卿照前的工作也变得异常忙碌，每天他一边在诊室问诊咨询，一边奔走于医院各科室为新冠危急重症病人把脉开方。

　　“现在本部急诊科EICU的床位每天都是满满的，90%的患者都是有基础疾病合并新冠病毒。科室每天都会邀请中医师来到重症病房，为患者开出一人一方，采用中药治疗，效果显著。有的重症患者通过中医药治疗症状减轻，有的危急重症患者被成功治愈。”急诊科主任兰岚介绍说。

　　在针灸康复科，科室制定了个性化的中西医综合诊疗方案。76岁的康奶奶因新冠病毒感染，导致基础疾病复发，出现膝关节疼痛肿胀、不能行走的症状。针灸康复科主任杜革术带领团队全面系统评估病情，实施综合康复治疗方案，予以针刺，配合电针、刺络拔罐、梅花针，同时运用艾灸、物理治疗、口服中药等治疗。7天后，康奶奶症状显著改善，可自行行走。

　　呼吸内科·内分泌科主任张向红也感染了新冠病毒，出现高热、咳嗽、乏力等各种不适，可她却仍然带病坚持。张向红介绍，“我能较快恢复，得益于中医药的治疗，现在每天仍喝中药调理。同时对有需求的患者开出对症的润肺止咳方、清肺排毒方、宣肺祛邪方、健脾养肺方等中药治疗方和调理方，我和我的患者都是中医药治疗的受益者”。（记者/武玥彤 供稿/长沙中医医院 郑朝晖）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）